Les Archives de microbiologie clinique utilisent un système de suivi éditorial pour la soumission, la révision et le suivi des manuscrits en ligne. Les membres du comité de rédaction de la revue ou des experts externes examinent les manuscrits ; au moins deux approbations d'évaluateurs indépendants suivies par l'éditeur sont requises pour l'acceptation et la publication de tout manuscrit pouvant être cité. Cette revue assure la publication continue d'articles semestriellement. Il accueille favorablement la soumission de manuscrits répondant aux critères généraux d’importance et d’excellence scientifique. Les articles seront examinés par des pairs par d’éminents chercheurs dans le domaine choisi.