Les pêcheries dans des eaux plus salées que l'eau douce sont appelées pêcheries en eaux saumâtres. La qualité du sol et de l'eau pour l'aquaculture en eau saumâtre est presque similaire à celle de l'aquaculture en eau douce, à l'exception de la salinité de l'eau. La salinité représente la quantité de sel dissous dans une unité d'eau donnée et est généralement exprimée en g/kg d'eau (ppt). Dans les étangs d'eau saumâtre, la salinité varie généralement entre 0,5 % et 30 % en fonction de la distance à la mer et des variations saisonnières dues aux précipitations de mousson.